SMK Negeri 3 Kudus mengelola 4 bidang kealian, yaitu: Agribisnis Pengolahan Hasil Pertanian, Tata Busana, Teknik Kendaraan Ringan Otomotif dan Teknik Komputer Jaringan.
Selain pembelajaran yang dilakukan di sekolah, siswa juga diwajibkan mengikuti program prakerin guna memberikan pengalaman kerja langsung untuk menanamkan iklim kerja positif yang berorientasi mutu
